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汪孟冉 (汪孟冉.) | 陈丹瑛 (陈丹瑛.) | 何小周 (何小周.) | 叶景荣 (叶景荣.) | 余双庆 (余双庆.) | 徐柯 (徐柯.) | 曾毅 (曾毅.) | 冯霞 (冯霞.)

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Abstract:

目的 克隆并分析HIV-1B/C重组型外膜蛋白env基因序列,根据其氨基酸序列进行表型预测,为疫苗的抗原设计奠定基础.方法 采集北京地区HIV-1 B/C重组型的抗凝全血标本,分离血浆和提取基因组DNA,采用巢式PCR方法扩增rev-env基因,对扩增产物进行序列测定.根据核苷酸序列推导出相应的氨基酸序列,并对重要的Env功能结构域进行深入的分析和比较.结果 从12例B/C重组型HIV-1感染者中成功克隆到7个rev-env基因,序列分析发现其中6个有完整的开放读码框(ORF),全部为CRF_07B/C重组型.6个Env蛋白氨基酸N糖基化位点和数目没有显著变化;CD4受体结合位点高度保守;根据V3环氨基酸序列及静电荷数目预测全部使用CCR5辅助受体;GP120/GP41剪切位点高度保守,预测所有GP160前体都能有效剪切;对几个已知中和抗体的中和位点分析推测全部的6个序列都对2G12、2F5中和不敏感;对4E10、PG9及PG16中和敏感.结论 有必要进一步阐明env基因型与相关功能的关系,这将为疫苗和药物研究提供依据.

Keyword:

序列测定 基因,env HIV-1

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  • [ 1 ] [汪孟冉]北京工业大学
  • [ 2 ] [陈丹瑛]北京工业大学
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Source :

中华实验和临床病毒学杂志

ISSN: 1003-9279

Year: 2014

Issue: 3

Volume: 28

Page: 203-205

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