• Complex
  • Title
  • Keyword
  • Abstract
  • Scholars
  • Journal
  • ISSN
  • Conference
搜索

Author:

孔令强 (孔令强.) | 李晓琴 (李晓琴.)

Indexed by:

CQVIP

Abstract:

蛋白质折叠类型分类是蛋白质分类研究的重要内容.以SCOP数据库中的PH domain -like barrel折叠类型为研究对象,选择序列相似度小于25%的61个样本为检验集,通过结构特征分析,确定了该折叠类型的模板及其对应的特征参数,利用模板与待测蛋白的空间结构比对信息,提出了一个新的折叠类型打分函数Fscore,建立了基于Fscore的蛋白质折叠类型分类方法并用于该折叠类型的分类.用此方法对Astral1.75中序列相似度小于95%的16711个样本进行检验,分类结果的特异性为99.97%.结果表明:特征参数抓住了折叠类型的本质,打分函数Fscore及基于Fscore建立的分类方法可用于PH domain - like barrel蛋白质折叠类型自动分类.

Keyword:

折叠类型分类 折叠类型 标准模板 打分函数

Author Community:

  • [ 1 ] [孔令强]北京工业大学
  • [ 2 ] [李晓琴]北京工业大学

Reprint Author's Address:

Email:

Show more details

Related Keywords:

Source :

生物信息学

ISSN: 1672-5565

Year: 2012

Issue: 2

Volume: 10

Page: 125-129

Cited Count:

WoS CC Cited Count: 0

SCOPUS Cited Count:

ESI Highly Cited Papers on the List: 0 Unfold All

WanFang Cited Count: 5

Chinese Cited Count:

30 Days PV: 5

Affiliated Colleges:

Online/Total:408/10586717
Address:BJUT Library(100 Pingleyuan,Chaoyang District,Beijing 100124, China Post Code:100124) Contact Us:010-67392185
Copyright:BJUT Library Technical Support:Beijing Aegean Software Co., Ltd.