• Complex
  • Title
  • Keyword
  • Abstract
  • Scholars
  • Journal
  • ISSN
  • Conference
搜索

Author:

刘岳 (刘岳.) | 徐海松 (徐海松.) | 乔辉 (乔辉.) | 李晓琴 (李晓琴.)

Indexed by:

CQVIP CSCD

Abstract:

蛋白质折叠识别是蛋白质结构研究的重要内容。双绕是α/β蛋白质中结构典型的常见折叠类型。选取22个家族中序列一致性小于25%的79个典型双绕蛋白质作为训练集,以RMSD为指标进行系统聚类,并对各类建立基于结构比对的概形隐马尔科夫模型(profile-HMM)。将Astral1.65中序列一致性小于95%的9 505个样本作为检验集,整体识别敏感性为93.9%,特异性为82.1%,MCC值为0.876。结果表明:对于成员较多,无法建立统一模型的折叠类型,分类建模可以实现较高准确率的识别。

Keyword:

折叠类型识别 系统聚类 隐马尔科夫模型 双绕蛋白质 RMSD

Author Community:

  • [ 1 ] 北京工业大学生命科学与生物工程学院

Reprint Author's Address:

Email:

Show more details

Related Keywords:

Related Article:

Source :

生物信息学

Year: 2010

Issue: 01

Volume: 8

Page: 1-6

Cited Count:

WoS CC Cited Count: 0

SCOPUS Cited Count:

ESI Highly Cited Papers on the List: 0 Unfold All

WanFang Cited Count:

Chinese Cited Count:

30 Days PV: 6

Online/Total:393/10585825
Address:BJUT Library(100 Pingleyuan,Chaoyang District,Beijing 100124, China Post Code:100124) Contact Us:010-67392185
Copyright:BJUT Library Technical Support:Beijing Aegean Software Co., Ltd.