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王丽东 (王丽东.) | 王存新 (王存新.)

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CQVIP PKU CSCD

Abstract:

HIV-1整合酶(IN)通过依赖金属离子的两步反应将病毒DNA整合入宿主细胞中.结合于HIV-1上的金属离子个数的变化直接影响整合酶与抑制剂之间的结合.用同源模建方法搭建了每条单链核心区具有两个Mg2+的(2Mg-IN-Core)和具有一个Mg2+的HIV-1IN二聚体核心区模型(1Mg-IN-Core).通过分子对接分别得到它们与硫氮硫扎平类化合物能量较低的复合物结构,并对对接结果进行了比较.研究发现:当整合酶中结合的Mg2+个数改变时,它与抑制剂的结合模式也会发生很大的变化;抑制剂能够特异且稳定地与2Mg-IN-Core模型的活性位点结合;同时与ASP64和GLU152螯合的那个Mg2+离...

Keyword:

分子模拟 金属离子 硫氮硫扎平类抑制剂 HIV-1整合酶

Author Community:

  • [ 1 ] 重庆工商大学药物化学与化学生物学研究中心
  • [ 2 ] 北京工业大学生命科学与生物工程学院 重庆400067
  • [ 3 ] 北京100022

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Source :

化学学报

Year: 2008

Issue: 07

Page: 817-822

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