科技强国战略背景下，创新质量与创新生境的同频共振成为区域经济迈向高质量发展的首要前提和重要基础，是粤港澳大湾区激发城市群创新活力、打造世界级创新经济湾区的核心抓手。基于熵权TOPSIS、耦合协调模型、ESDA、地理探测器、GWR等方法，探索大湾区创新“质量—生境”系统耦合协调关系的空间分异特征及驱动机制，以期在新一轮全球科技与产业革命中，为粤港澳大湾区在特殊格局下寻求政策制度的创新和突破提供新思路。研究发现：第一，粤港澳大湾区呈现以广州、深圳、香港为核心向周围辐射创新影响的发展模式，创新生境的空间分布最为均衡。基本协调状态的城市分布于“广深科技创新走廊”沿线，是区域创新的优势空间，而中度失调的城市存在区域锁定。耦合协调发展的空间正向自相关显著，珠海、中山、江门位于低值集聚区。第二，所有维度因子均显著驱动耦合协调发展，且交互作用后的解释程度得到不同程度提升。不同城市的耦合协调状态对各因素的反馈效应具有明显的地域差异。第三，广深港作为粤港澳大湾区的核心城市，在研发、经济、人力等方面具有绝对优势，在广州优势价值链资源的直接辐射及高值区域集聚效应影响下，邻近城市各要素驱动效用显著。而边缘城市受内外多重因素制约，要素驱动力不足，存在低耦合协调及发展状态不同步问题。鉴于此，政府应加快建立和完善创新要素一体化的市场体制，助力创新增长极发挥辐射带动作用，完善区域高素质人才培养体系，以市场需求为导向，因地制宜最大化发挥政策效用，推动整体区域创新耦合协调实现良性适配均衡发展，助力粤港澳大湾区以科技创新赋能高质量发展。