Abstract：
从西藏墨脱嘎隆拉山海拔3 000m土壤中分离出一株革兰氏阳性类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.),用Illumi-na Hiseq测序平台进行全基因组测序以及通过Prokka1.14.6 软件进行基因组注释.结合antiSMASH 7.0 和BAGEL 4 分析Paenibacillus sp.基因组预测次级代谢产物生物合成基因簇.为了验证代谢产物路径,用不同破碎方法提取菌株全蛋白,通过蛋白质组质谱技术进行分析,结合不同蛋白质组分析软件,共鉴定了3 383 个蛋白质.通过同源比对,提取的蛋白质中可以检测到套索肽生物合成基因簇中依赖ATP半胱氨酸蛋白酶N端区域B1 和ABC转运器.同时,用BAGEL4 软件blastp功能从NCBI数据库中获取Paenibacillus sp.基因组中潜在完整的套索肽生物合成基因簇.
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应用化工
ISSN： 1671-3206
Year： 2024
Issue： 4
Volume： 53
Page： 797-801
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