虽然科斯的交易成本经济学影响巨大,但科斯的思想方法是怎样的至今依然并不清晰.科斯是运用基于机会成本概念的常识最大化方法在分析问题,所谓的交易成本概念无非是机会成本概念运用于人际协调的语境而产生的.借助于此概念,科斯将常识的最大化思想应用普遍化,形成了一套截然不同于以萨缪尔森为代表的正统经济学分析的研究思路,此过程伴随着科斯的思想演变的两次飞跃:一是从机会成本概念到在企业家决策语境下的交易成本概念的飞跃;二是从企业家决策语境下的、具有特定所指的交易成本概念到普遍化的、不具有特定所指的交易成本概念的飞跃.科斯的一系列方法论主张,如对于经验调查的强调、对经济学研究对象的强调、对于经济学的基本假定必须真实性的坚持等,都必须基于他所采用的常识最大化方法才能得到正确的理解.