Abstract:
大肠杆菌的维生素B12转运蛋白(BtuCD)属于ATP结合盒转运蛋白,目前对BtuCD转运底物进入胞质内的确切机制仍不清楚.本研究将BtuCD的跨膜结构域BtuC插入棕榈酰油酸磷脂酰胆碱(POPC)双层膜中,通过MD模拟来研究BtuC的功能性运动.通过超过57ns的MD模拟得到了稳定的蛋白质-脂双层膜体系.模拟结果发现,POPC双层膜能够调整其厚度以适应其中的BtuC.反映脂双层膜性质的两个参数,即每个脂分子的面积和脂双层膜厚度,均与实验测得数据吻合.通过对从MD模拟提取的轨迹进行主成分分析(PCA),使得能从原子水平上了解BtuC的几种主要运动模式.结果表明,尽管BtuC的几种主要运动模式各...
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中国科学(C辑:生命科学)
Year: 2009
Issue: 06
Volume: 39
Page: 567-578
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