• Complex
  • Title
  • Keyword
  • Abstract
  • Scholars
  • Journal
  • ISSN
  • Conference
搜索

Author:

苏计国 (苏计国.) | 王宝翰 (王宝翰.) | 焦雄 (焦雄.) | 陈慰祖 (陈慰祖.) | 王存新 (王存新.)

Indexed by:

CQVIP PKU CSCD

Abstract:

把20种氨基酸简化为3类:疏水氨基酸(hydrophobic,H)、亲水氨基酸(hydrophilic,P)及中性氨基酸(neutral,N),每个氨基酸简化为一个点,用其Cα原子来代替.采用非格点模型,以相对熵作为优化函数,进行蛋白质三维结构预测.为了与基于相对熵方法的蛋白质设计工作进行统一,采用了新的接触强度函数.选用蛋白质数据库中的天然蛋白质作为测试靶蛋白,结果表明,采用该模型和方法取得了较好的结果,预测结构相对于天然结构的均方根偏差在0.30~0.70 nm之间.该工作为基于相对熵及HNP模型的蛋白质设计研究打下了基础.

Keyword:

相对熵 蛋白质折叠 氨基酸简化模型

Author Community:

  • [ 1 ] [苏计国]北京工业大学
  • [ 2 ] [王宝翰]中国科学院生物物理研究所
  • [ 3 ] [焦雄]北京工业大学
  • [ 4 ] [陈慰祖]北京工业大学
  • [ 5 ] [王存新]北京工业大学

Reprint Author's Address:

Email:

Show more details

Related Keywords:

Related Article:

Source :

生物化学与生物物理进展

ISSN: 1000-3282

Year: 2006

Issue: 5

Volume: 33

Page: 479-484

0 . 3 0 0

JCR@2022

ESI Discipline: BIOLOGY & BIOCHEMISTRY;

JCR Journal Grade:4

Cited Count:

WoS CC Cited Count: 0

SCOPUS Cited Count:

ESI Highly Cited Papers on the List: 0 Unfold All

WanFang Cited Count: 12

Chinese Cited Count:

30 Days PV: 7

Affiliated Colleges:

Online/Total:290/10507504
Address:BJUT Library(100 Pingleyuan,Chaoyang District,Beijing 100124, China Post Code:100124) Contact Us:010-67392185
Copyright:BJUT Library Technical Support:Beijing Aegean Software Co., Ltd.