OBJECTIVE:　To　cure　atrial　fibrillation,　the　maximum　ablation　depth　(＞=　50　degrees　C)　should　exceed　the　myocardial　thickness　to　achieve　the　effect　of　transmural　ablation.　The　blood　flow　of　pulmonary　vein　in　the　endocardium　can　cause　the　change　in　the　myocardial　temperature　distribution.　Therefore,　the　study　investigated　the　effect　of　different　pulmonary　vein　blood　flow　velocities　on　the　endocardial　microwave　ablation.　METHODS:　The　finite　element　model　of　the　endocardial　microwave　ablation　of　pulmonary　vein　was　simulated　by　electromagnetic　thermal　flow　coupling.　The　ablation　power　was　30　W　and　the　ablation　time　was　within　30　s.　The　blood　flow　in　the　coupling　of　fluid　mechanics　equation　and　heat　transfer　equation　results　in　the　heat　damage.　Furthermore,　the　cause　of　the　different　lesion　dimensions　is　the　blood　flow　velocity.　The　flow　velocities　were　set　as　0,　0.02,　0.05,　0.07,　0.12,　0.16,　0.20,　0.25　and　0.30　m/s.　RESULTS:　When　the　flow　velocities　were　0,　0.02,　0.05,　0.07,　0.12,　0.16,　0.20,　0.25　and　0.30　m/s,　the　maximum　ablation　depth　were　6.00,　5.56,　5.16,　5.12,　5.04,　5.01,　4.98,　4.96　and　4.94　mm,　respectively;　the　maximum　ablation　width　were　12.53,　9.63,　9.23,　9.16,　9.07,　9.05,　8.94,　8.91　and　8.90　mm,　respectively;　the　maximum　ablation　length　were　12.00,　11.61,　8.98,　8.59,　8.37,　8.23,　8.16,　8.06　and　8.04　mm　respectively.　To　achieve　transmural　ablation,　the　time　was　3,　3,　3,　3,　3,　4,　4,　4,　4　s,　respectively　when　the　myocardial　thickness　was　2　mm;　the　time　was　7,　8,　8,　8,　9,　9,　9,　9,　9　s,　respectively　when　3　mm;　the　time　was　15,　16,　18,　19,　19,　20,　20,　20,　20　s,　respectively　when　4　mm.　CONCLUSIONS:　When　the　velocity　increases　from　0　m/s　to　0.3　m/s,　the　microwave　lesion　depth　decreases　by　1.06　mm.　To　achieve　transmural　ablation,　when　the　myocardial　thickness　is　2　mm,　3　and　4　s　should　be　taken　when　the　velocity　is　0-0.12　and　0.12-0.30　m/s,　respectively;　when　the　myocardial　thickness　is　3　mm,　7,　8　and　9　s　should　be　taken　when　0,　0-0.07　and　0.07-0.30　m/s　respectively;　when　the　myocardial　thickness　is　4　mm,　15,　16,　18,　19,　20　s　should　be　taken　when　0,　0-0.02,　0.02-0.05,　0.05-0.12,　0.12　m/s-0.30　m/s.