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张雪文 (张雪文.) | 张娜 (张娜.) | 李春华 (李春华.) (Scholars:李春华) | 孙国辉 (孙国辉.) | 赵丽娇 (赵丽娇.) (Scholars:赵丽娇) | 钟儒刚 (钟儒刚.) (Scholars:钟儒刚)

Abstract:

目的 构建CK2天然产物类抑制剂的定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型,揭示影响该类抑制剂活性的结构因素,为新型CK2抑制剂的开发提供理论基础和实验依据.方法 基于文献报道的115个多骨架CK2天然产物类抑制剂,采用遗传算法(genetic algorithm,GA)联合多元线性回归(multiple linear regression,MLR)方法,建立了基于优选的Dragon描述符的QSAR模型,以留一法交叉验证系数Q2LOO以及相关系数R2作为模型内部验证的评价指标;通过Q2ext和R2ext评估模型的外部预测能力.结果 最优2D-QSAR模型由8个描述符组成,基于训练集内部验证的统计学参数为Q2Loo=0.7914、R2=0.8220;基于测试集外部验证的统计学参数为Q2ext=0.7921、R2ext=0.7998,表明该模型具有较高的可靠性和预测能力.结论 影响CK2天然产物类抑制剂活性的分子描述符包括IVDE、CATS2D_08_DA、nArX、IC1、Chi_D/Dt、SdssC、F08[C-O]以及C-006.本研究可为新型CK2抗癌抑制剂的发现提供实验指导.

Keyword:

定量结构-活性关系 天然产物类抑制剂 遗传算法 多元线性回归 蛋白激酶CK2

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  • [ 1 ] [张娜]北京工业大学
  • [ 2 ] [孙国辉]北京工业大学
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  • [ 6 ] [赵丽娇]北京工业大学

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Source :

北京生物医学工程

ISSN: 1002-3208

Year: 2023

Issue: 1

Volume: 42

Page: 81-87

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