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考虑界面信息和相互作用能的蛋白质‑DNA结合亲和性预测方法，属于蛋白质‑DNA相互作用与识别预测技术领域。首先构建训练集和测试集，根据实验结合亲和性数据以及复合物结构PDB ID号，取得340个样本，其中36个作为独立测试集，其余作为训练集；然后按以下三个步骤进行：1：对复合物结构进行分类；2：提取复合物特征；3：使用集成回归模型预测复合物结合亲和性。在此过程种，根据DNA结构类型和蛋白质上结合残基占比对复合物进行分类，并针对每种复合物类型提取各自的最优特征组合；除蛋白质和DNA的序列和结构特征外，加入了界面特征和相互作用能特征。
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Type： 发明申请
Patent No.： CN202210785327.9
Filing Date： 2022-06-30
Publication Date： 2024-06-11
Pub. No.： CN115083515B
Applicants： 北京工业大学
Legal Status： 授权
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