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何红秋 (何红秋.) | 胡建平 (胡建平.) | 刘斌 (刘斌.) | 陈慰祖 (陈慰祖.) | 王存新 (王存新.)

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CQVIP PKU CSCD

Abstract:

表达纯化了野生型(WT)及F185K突变型HIV-1整合酶核心区蛋白(INC),并对二者的溶解性和活性进行了比较.实验结果表明:F185K突变后INC溶解性显著提高,活性有一定程度降低.对WT和F185KINC体系进行了1800ps的分子动力学模拟.模拟结果表明:F185KINC功能loop区柔性和蛋白质整体运动性降低,使蛋白质活性降低,F185K突变后盐桥网络的变化驱动了INC局部构象改变,引起INC表面的部分疏水残基被包埋,亲水残基暴露,相对亲水溶剂可接近面积增大,同时,突变后INC与水之间形成氢键的数量增加,与水之间作用加强,以上变化使INC溶解性提高.分子动力学模拟与实验结果相吻合.为...

Keyword:

分子动力学模拟 活性 溶解性 HIV-1整合酶

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  • [ 1 ] 北京工业大学生命科学与生物工程学院
  • [ 2 ] 乐山师范学院化学与生命科学学院

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Source :

生物化学与生物物理进展

Year: 2009

Issue: 09

Volume: 36

Page: 1146-1153

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