为探究超大直径盾构隧道下穿既有车站地下结构的施工控制问题,依托北京城市副中心东六环改造工程,结合现场实测数据与数值模拟对超大直径盾构隧道和桩筏基础的互相影响进行研究,分析下穿进程中地下结构筏板的变形规律,在和现场实测数据比对验证模型的准确性后,提出有效的施工控制措施。结果表明:地下结构基底筏板在竖直方向的位移整体呈现类似“M”型分布特征,引发变形的施工控制因素包括注浆措施、回填层厚度以及双线隧道施工间距;对这类地下结构主要采用了3种施工控制方法,包括同步注浆和壁后注浆联合加固增强措施、地下结构顶板覆2　m回填层施压,以及双线隧道依次穿越地下结构,施工间距至少保持300　m以上等,这些措施的联合使用取得了显著的变形控制效果。