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赵迎春 (赵迎春.) | 李春华 (李春华.)

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内向整流型钾通道蛋白Kir3.2能够调节钾离子的跨膜流动,具有重要的生理功能。由于其与神经和心肌系统的疾病相关,因此是一个重要的药物靶点。为研究该通道的动力学和功能性关键位点,我们首先利用高斯网络模型(GNM)对该通道进行建模,分析其结构的柔性,及各功能区域间的运动相关性;然后,构建运动相关性加权的复杂网络模型,通过依次敲除节点获得网络特征路径长度的变化来识别关键位点。结果发现,GNM重现了通道各区域的柔性;界面螺旋、跨膜螺旋和CTD区域间存在显著的运动正相关,这促进了通道与配体的结合和结构的稳定;所识别的关键残基对通道的激活、结构的稳定和变构信号交流起重要作用。本工作有助于加强对Kir3.2通道工作机制的理解,所识别的功能位点可为药物设计提供有价值的信息。

Keyword:

关键残基 内向整流型钾通道Kir3.2 Gaussian Network Model 复杂网络模型 Complex Network Model Inward Rectifier Potassium Channel Kir3.2 高斯网络模型 Key Residues

Author Community:

  • [ 1 ] [李春华]北京工业大学环境与生命学部,北京
  • [ 2 ] [赵迎春]北京工业大学环境与生命学部,北京

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Source :

生物物理学

ISSN: 2330-1686

Year: 2023

Issue: 4

Volume: 11

Page: 65-72

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